Engenharia genética/Amplificação por PCR do gene GFP de Aequorea victoria: diferenças entre revisões

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1. Fazer uma diluição de 50X, em 2 tubos Eppendorf (marcados 1 a 2), fazendo 2 diluições sucessivas de 10X a partir de 100 ml Taq e 900 ml de tampão dilution 1X e depois 5X (200 uL800uL).

2. Fazer 3 diluições de 2X sucessivas em 3 tubos Eppendorf (marcados 3 a 5) a partir de 500 ml da diluição de 1000X e 500 ml de tampão dilution 1X.

3. Adicionar 20 ml das diluições a cada tubo de PCR (10X; 50X; 100X; 200X; 400X) (5 tubos).

4. Adicionar 20 ml da PCR Master Mix a cada tubo de PCR

6. Colocar os tubos em gelo.

7. As misturas, depois de agitadas no vortex, são sujeitas a PCR nas seguintes condições:

120 segundos, 94C (desnaturação inicial)
20 segundos, 94C (desnaturação)
20 segundos, 40C (emparelhamento)
20 segundos (Taq) ou 1min 45s (Pfu) , 72C (enlongamento)
120 segundos, 72C (enlongamento final)

Esta sequência é repetida 30 vezes

8. Durante o tempo de espera, desenhar no computador os primers necessários para amplificar o gene GFP.

9. Misturar 5 ml de produto de PCR com 5 ml de tampão de aplicação.

10. Aplicar as amostras num gel de agarose 0,8%.

11. O instructor irá fazer um gel com as amostras correspondentes aos produtos de PCR de referência.

12. Correr o gel, durante 20 minutos, a 220 volts.

13. Fotografar o gel.

14. Comparar o rendimento do PCR com o rendimento obtido com a Taq polímeras comercial.

15. Calcular o número de unidades na preparação.


# Fazer uma diluição de 50X, em 2 tubos ''eppendorf'' marcados (1 e 2), fazendo 2 diluições sucessivas de 10X a partir de 100 mL de Taq e 900 mL do tampão de diluição 1X e depois 5X (200 μL → 800μL);
# Fazer 3 diluições sucessivas de 2X em 3 tubos ''eppendorf'' marcados (3, 4 e 5) a partir de 500 mL da diluição de 1000X e 500 mL de tampão de diluição 1X;
# Colocar 20 mL das diluições em diferentes tubos de PCR: 10X; 50X; 100X; 200X; 400X (5 tubos);
# Adicionar 20 mL de PCR ''MasterMix'' a cada tubo de PCR;
# Colocar os tubos em gelo;
# Depois de agitadas no ''vortex'', as misturas são sujeitas a PCR de acordo com as condições especificadas na tabela abaixo;
# Durante o tempo de espera, desenhar no computador os ''primers'' necessários para amplificar o gene GFP;
# Misturar 5 mL de produto de PCR com 5 mL de tampão de aplicação;
# Aplicar as amostras num gel de agarose 0,8%;
# O instrutor irá fazer um gel com as amostras correspondentes aos produtos de PCR de referência;
# Correr o gel, durante 20 minutos, a 220 volts;
# Fotografar o gel;
# Comparar o rendimento do PCR com o rendimento obtido com a Taq polimerase comercial;
# Calcular o número de unidades na preparação.






<center>
=== Condições do PCR ===
{| border '''Temperatura'''
| '''Temperatura'''|| '''Duração'''|| '''Fase'''
|-
| 94 ºC|| 120 seg || Desnaturação inicial
|-
| 94 ºC|| 20 seg || Desnaturação
|-
| 40 ºC|| 20 seg|| Emparelhamento
|-
| 72 ºC|| '''Taq''' = 20 seg e '''Pfu'''= 1 min 45 seg|| Elongamento
|-
| 72 ºC|| 120 seg|| Elongamento final
|}


Esta sequência é repetida 30 vezes. </center>





Revisão das 11h56min de 22 de fevereiro de 2008


  1. Fazer uma diluição de 50X, em 2 tubos eppendorf marcados (1 e 2), fazendo 2 diluições sucessivas de 10X a partir de 100 mL de Taq e 900 mL do tampão de diluição 1X e depois 5X (200 μL → 800μL);
  2. Fazer 3 diluições sucessivas de 2X em 3 tubos eppendorf marcados (3, 4 e 5) a partir de 500 mL da diluição de 1000X e 500 mL de tampão de diluição 1X;
  3. Colocar 20 mL das diluições em diferentes tubos de PCR: 10X; 50X; 100X; 200X; 400X (5 tubos);
  4. Adicionar 20 mL de PCR MasterMix a cada tubo de PCR;
  5. Colocar os tubos em gelo;
  6. Depois de agitadas no vortex, as misturas são sujeitas a PCR de acordo com as condições especificadas na tabela abaixo;
  7. Durante o tempo de espera, desenhar no computador os primers necessários para amplificar o gene GFP;
  8. Misturar 5 mL de produto de PCR com 5 mL de tampão de aplicação;
  9. Aplicar as amostras num gel de agarose 0,8%;
  10. O instrutor irá fazer um gel com as amostras correspondentes aos produtos de PCR de referência;
  11. Correr o gel, durante 20 minutos, a 220 volts;
  12. Fotografar o gel;
  13. Comparar o rendimento do PCR com o rendimento obtido com a Taq polimerase comercial;
  14. Calcular o número de unidades na preparação.


Condições do PCR

Temperatura Duração Fase
94 ºC 120 seg Desnaturação inicial
94 ºC 20 seg Desnaturação
40 ºC 20 seg Emparelhamento
72 ºC Taq = 20 seg e Pfu= 1 min 45 seg Elongamento
72 ºC 120 seg Elongamento final
Esta sequência é repetida 30 vezes.